Es muy sencillo. En un documento de word, en la vista esquema se ponen los titulos, cada uno a su nivel. Luego se pone el cursor al inicio del documento, y en "Referencia" se le da a "Tabla de contenido", "insertar tabla de contenido", se elige el formato o estilo y la cantidad de títulos o niveles que habrá en el índice, y no olvidéis quitar la marca sobre "mostrar números de páginas" (porque muestra las numeraciones del texto, pero tened en cuanta que ese documento acabará siendo fluido, por lo que no interesa que las páginas estén numeradas).
Cada vez que hagáis algún cambio en los título, tenéis que darle a "actualizar tabla" (está al lado de "insertar tabla").
Una vez terminado el documento, lo convertís para verlo en el e-book. Yo lo hago con el mobipocket.
En el lector, veréis el texto, con su índice. Al pulsar sobre cualquier parte de ese índice, iréis directamente a ese capítulo o apartado.
El problema con los apuntes de esta página es que están protegidos, y tendréis que pasarlos a word. Por eso es muy interesante cuando algún compañero cuelga sus apuntes en word y sin protección. Como los de Iota, por ejemplo.
Saludos