Estimado compañero:
En primer lugar decirte que el profesor, creo que ha actuado correctamente ya que está haciendo su trabajo (evitar que los alumnos copien). Para ello te ha requerido que apartes el libro de tu alcance y los apuntes (todo ello con buen criterio). No obstante, como no nos gusta que nos llamen la atención, nos cabreamos.
En segundo lugar, te ha dejado que hagas el examen, lo cual quiere decir que si hubiera querido, te hubiera expulsado de la sala con un tremendo cero en el examen, que a estas alturas, siendo esta convocatoria la última de la licenciatura, te hubiera machacado la decisión.
En tercer lugar, lo que te ocurrirá es lo siguiente: el profesor ha cogido los apuntes, se los llevó a la mesa de los profesores, tu entregastes el examen, ellos lo escanearon y lo enviaron a Madrid donde lo revisarán y si estás aprobado te aprobaran la asignatura. Ten fe ya que esto es lo que pasará. Tranquilo que no te van a suspender (a salvo que hayas hecho el examen mal). Y si solo tienes Romano de 1º, y has suspendido, con sacar de media más de un 3, podrás pedir la compensación.
En cuarto lugar, por si de caso no funciona nada de lo que te he dicho, te aconsejo que esperes a que los examenes estén colgados en la pagina Web de la Facultad, y una vez te los descarges (están en formato PDF), podrás comprobar si el profesor ha puesto alguna coletilla en el examen (del tipo de que "lo pillé con apuntes, aunque no copiando", etc. Esperate a que esté colgado el examen en la pagina Web, y en función de ello llamas o no al departamento. Yo personalmente no llamaría hasta no tener la seguridad de que han incluido alguna "coletilla".
En quinto lugar, si falla todo lo que te he dicho, mejor que pongas un par de velas (todos los días) en la iglesia mas cercana a donde vives, y te encomiendes al santo que te toque.
Saludos desde Valencia.