En determinadas asignaturas si que se hace media (teniendo una nota mínima en el aprobado, y una mínima en el suspenso, no con 7 y 3, por ejemplo), pero esto es siempre con carácter excepcional. La norma general, como ha dicho la compañera, es que no se hace.
Y, efectivamente, si en septiembre suspendes cualquiera de los dos parciales, al año siguiente tienes que cogerla de nuevo enterita.