La nota del segundo parcial de una asignatura anual, exclusivamente es la que obtengas en dicho 2º parcial pero que si te servirá para la calificación anual de la asignatura, obtenida esta con la nota media con ambos parciales, siempre y cuando tengas los dos parciales aprobados.
Hay alguna asignatura, ahora no recuerdo cual, que te permite tener un 4 en uno de los parciales y aprobar la asignatura si en el otro parcial has obtenido un 6.
Si sólo apruebas un parcial de una asignatura anual, tendrás que presentarte en septiembre de dicho parcial y si en septiembre no apruebas no te vale la nota del parcial aprobado para el próximo curso.
Saludos.