Una cosa: a todos los efectos las convocatorias que cuentan son las de septiembre, al menos en licenciatura. Quiere decir que si te presentas en febrero y/o junio, y no en septiembre no cuenta convocatoria, no corre convocatoria mientras no te presentes en septiembre, si es eso lo que te preocupa. Luego anulado sería a nivel de convocatorias aunque se perdiera dinero. Tendrías las que tengas empezando de cero (no perderías una convocatoria, quiero decir).
Si es el tema económico, si fraccionaste el pago y no has realizado el segundo pago, perderías el primer pago. Si hiciste pago único... entonces perdido todo.
Como el plazo para el segundo pago, al menos en licenciatura, acaba hoy 14 de enero de 2011, si lo fraccionaste y deseas anular, habla con tu banco si domiciliaste para que devuelvan este segundo pago, que no lo admitan, al menos eso que no se pierde. Si no está domiciliado el pago, no lo realices si tu decisión es anular la matrícula.
Saludos.