Aunque no lo presentaran en el registro civil es válida, mirate el art.266 del Reglamento del Registro Civil, el único inconveniente es que al no estar inscrito en el registro no es oponible a terceros pero entre los cónyuges es totalmente válido.
De todas formas, dile a las señora que vaya a un abogado matrimonialista y le asesorara en todo los relativo a su separación.
Un saludo